Named species · GMrepo v3 · NCBI lineage

Microbes

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624 species

Most studiedMost common in healthy guts

Species	Healthy guts	Samples ↓
Escherichia coli Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	55%	14,839
Parasutterella excrementihominis Pseudomonadota · Sutterellaceae	43%	9,458
Sutterella wadsworthensis Pseudomonadota · Sutterellaceae	43%	8,653
Haemophilus parainfluenzae Pseudomonadota · Pasteurellaceae	24%	5,526
Klebsiella pneumoniae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	16%	4,821
Mesosutterella multiformis Pseudomonadota · Sutterellaceae	7.3%	1,890
Enterobacter hormaechei Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	6.5%	1,649
Klebsiella variicola Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	5.9%	1,602
Citrobacter freundii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	4.7%	1,313
Enterobacter roggenkampii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	5.2%	1,271
Oxalobacter formigenes Pseudomonadota · Oxalobacteraceae	5.0%	1,191
Klebsiella quasipneumoniae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	4.0%	1,176
Citrobacter portucalensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	4.1%	1,068
Enterobacter kobei Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	4.4%	996
Duodenibacillus massiliensis Pseudomonadota · Sutterellaceae	5.1%	976
Escherichia marmotae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	3.1%	887
Klebsiella michiganensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	3.4%	833
Raoultella ornithinolytica Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	3.4%	786
Enterobacter asburiae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	3.2%	695
Enterobacter ludwigii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	3.1%	686
Citrobacter braakii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	2.1%	602
Parasutterella secunda Pseudomonadota · Sutterellaceae	2.8%	596
Klebsiella aerogenes Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	2.3%	586
Proteus mirabilis Pseudomonadota · Morganellaceae	1.4%	509
Haemophilus sputorum Pseudomonadota · Pasteurellaceae	2.1%	503
Klebsiella oxytoca Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	1.6%	491
Morganella morganii Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	486
Dakarella massiliensis Pseudomonadota · Sutterellaceae	2.2%	467
Klebsiella grimontii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	1.9%	433
Turicimonas muris Pseudomonadota · Sutterellaceae	1.4%	420
Comamonas kerstersii Pseudomonadota · Comamonadaceae	1.5%	377
Neisseria subflava Pseudomonadota · Neisseriaceae	1.1%	372
Aggregatibacter segnis Pseudomonadota · Pasteurellaceae	1.0%	363
Kluyvera ascorbata Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	1.4%	350
Enterobacter cloacae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	1.0%	335
Sutterella seckii Pseudomonadota · Sutterellaceae	1.9%	324
Pseudomonas aeruginosa Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	314
Sutterella parvirubra Pseudomonadota · Sutterellaceae	1.3%	309
Haemophilus pittmaniae Pseudomonadota · Pasteurellaceae	1.4%	295
Haemophilus haemolyticus Pseudomonadota · Pasteurellaceae	1.1%	276
Enterobacter bugandensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	1.0%	260
Enterobacter mori Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	1.1%	254
Hafnia paralvei Pseudomonadota · Hafniaceae	<1%	247
Kluyvera sichuanensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	233
Succinatimonas hippei Pseudomonadota · Succinivibrionaceae	<1%	225
Kluyvera cryocrescens Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	221
Sutterella faecalis Pseudomonadota · Sutterellaceae	1.2%	219
Haemophilus paraphrohaemolyticus Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	209
Hafnia alvei Pseudomonadota · Hafniaceae	<1%	190
Citrobacter koseri Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	181
Ralstonia pickettii Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	170
Leclercia adecarboxylata Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	162
Haemophilus parahaemolyticus Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	143
Eikenella corrodens Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	136
Ectopseudomonas guguanensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	125
Citrobacter amalonaticus Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	121
Kluyvera georgiana Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	121
Plesiomonas shigelloides Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	119
Acinetobacter johnsonii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	118
Lautropia mirabilis Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	116
Escherichia fergusonii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	115
Burkholderia puraquae Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	111
Phytobacter diazotrophicus Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	104
Cronobacter sakazakii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	97
Aeromonas veronii Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	90
Atlantibacter hermannii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	88
Aeromonas caviae Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	84
Sutterella megalosphaeroides Pseudomonadota · Sutterellaceae	<1%	84
Salmonella enterica Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	83
Neisseria sicca Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	82
Sutterella massiliensis Pseudomonadota · Sutterellaceae	<1%	76
Serratia marcescens Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	65
Stenotrophomonas maltophilia Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	61
Pseudomonas fragi Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	59
Acinetobacter baumannii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	53
Kluyvera intermedia Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	52
Moraxella osloensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	51
Agrobacterium fabrum Pseudomonadota · Rhizobiaceae	<1%	50
Enterobacter soli Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	50
Acidovorax temperans Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	49
Burkholderia contaminans Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	48
Providencia rettgeri Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	48
Aggregatibacter aphrophilus Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	43
Phyllobacterium calauticae Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	43
Providencia alcalifaciens Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	43
Pseudocitrobacter faecalis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	43
Ralstonia insidiosa Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	43
Pluralibacter gergoviae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	42
Acinetobacter ursingii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	40
Phytobacter massiliensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	39
Obesumbacterium proteus Pseudomonadota · Hafniaceae	<1%	38
Kosakonia cowanii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	36
Proteus vulgaris Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	36
Stutzerimonas stutzeri Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	36
Aggregatibacter kilianii Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	35
Pseudocitrobacter corydidari Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	35
Xanthomonas campestris Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	35
Enterobacter cancerogenus Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	33
Proteus terrae Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	30
Acinetobacter junii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	29
Enterobacter wuhouensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	29
Mesorhizobium hungaricum Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	28
Serratia liquefaciens Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	26
Acinetobacter lwoffii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	25
Lelliottia nimipressuralis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	25
Neisseria elongata Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	25
Psychrobacter faecalis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	25
Acinetobacter soli Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	24
Cupriavidus pauculus Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	24
Proteus penneri Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	24
Klebsiella spallanzanii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	23
Pseudomonas helleri Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	23
Comamonas thiooxydans Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	22
Enterobacter chuandaensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	22
Shewanella algae Pseudomonadota · Shewanellaceae	0%	22
Acinetobacter pittii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	20
Edwardsiella tarda Pseudomonadota · Hafniaceae	<1%	20
Pseudomonas putida Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	20
Roseateles puraquae Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	<1%	20
Aeromonas dhakensis Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	19
Delftia acidovorans Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	19
Kosakonia sacchari Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	19
Pseudescherichia vulneris Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	19
Haemophilus influenzae Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	18
Raoultella terrigena Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	18
Aeromonas hydrophila Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	17
Enterobacter huaxiensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	17
Lelliottia amnigena Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	17
Sphingomonas echinoides Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	<1%	17
Agrobacterium pusense Pseudomonadota · Rhizobiaceae	<1%	16
Lysobacter enzymogenes Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	16
Ralstonia mannitolilytica Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	16
Eikenella halliae Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	15
Hyphomicrobium denitrificans Pseudomonadota · Hyphomicrobiaceae	<1%	15
Acinetobacter bereziniae Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	14
Kingella bonacorsii Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	14
Pantoea dispersa Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	14
Pseudomonas cremoris Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	14
Pseudomonas lundensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	14
Comamonas denitrificans Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	13
Acinetobacter albensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	12
Alcaligenes faecalis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	12
Aquabacterium olei Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	0%	12
Pseudomonas citronellolis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	12
Pseudomonas fluorescens Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	12
Psychrobacter immobilis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	12
Sphingomonas beigongshangi Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	<1%	12
Acinetobacter parvus Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	11
Huaxiibacter chinensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	11
Pasteurella multocida Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	11
Acinetobacter guillouiae Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	10
Anaerobiospirillum succiniciproducens Pseudomonadota · Succinivibrionaceae	<1%	10
Brevundimonas diminuta Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	10
Ectopseudomonas chengduensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	10
Ectopseudomonas mendocina Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	10
Klebsiella huaxiensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	10
Pseudomonas psychrophila Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	10
Psychrobacter fulvigenes Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	10
Yersinia enterocolitica Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	10
Acinetobacter radioresistens Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	9
Bradyrhizobium elkanii Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	<1%	9
Comamonas testosteroni Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	9
Methylobacillus glycogenes Pseudomonadota · Methylophilaceae	0%	9
Neisseria bacilliformis Pseudomonadota · Neisseriaceae	0%	9
Oligella ureolytica Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	9
Pantoea agglomerans Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	9
Pseudenterobacter timonensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	9
Pseudomonas juntendi Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	9
Vulcaniibacterium thermophilum Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	9
Brucella anthropi Pseudomonadota · Brucellaceae	<1%	8
Burkholderia pseudomallei Pseudomonadota · Burkholderiaceae	0%	8
Cardiobacterium hominis Pseudomonadota · Cardiobacteriaceae	<1%	8
Halomonas hydrothermalis Pseudomonadota · Halomonadaceae	<1%	8
Hydrogenophilus thermoluteolus Pseudomonadota · Hydrogenophilaceae	<1%	8
Klebsiella indica Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	8
Moellerella wisconsensis Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	8
Phyllobacterium myrsinacearum Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	8
Providencia stuartii Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	8
Pseudomonas lactis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	8
Tepidimonas aquatica Pseudomonadota	0%	8
Uruburuella suis Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	8
Acinetobacter harbinensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	7
Acinetobacter schindleri Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	7
Acinetobacter towneri Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	7
Aeromonas enteropelogenes Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	7
Afipia broomeae Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	<1%	7
Brevundimonas aurantiaca Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	7
Brevundimonas mediterranea Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	7
Citrobacter sedlakii Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	7
Denitrificimonas caeni Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	7
Microvirgula aerodenitrificans Pseudomonadota · Aquaspirillaceae	<1%	7
Neisseria meningitidis Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	7
Pantoea piersonii Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	7
Pantoea septica Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	7
Pseudomonas paraversuta Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	7
Pseudomonas taetrolens Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	7
Thiopseudomonas denitrificans Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	7
Vibrio parahaemolyticus Pseudomonadota · Vibrionaceae	<1%	7
Acinetobacter nosocomialis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	6
Acinetobacter seifertii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	6
Aeromonas media Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	6
Agrobacterium tomkonis Pseudomonadota · Rhizobiaceae	<1%	6
Agrobacterium tumefaciens Pseudomonadota · Rhizobiaceae	<1%	6
Azonexus hydrophilus Pseudomonadota · Azonexaceae	<1%	6
Mixta calida Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	6
Neisseria cinerea Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	6
Providencia rustigianii Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	6
Pseudomonas carnis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	6
Salinicola peritrichatus Pseudomonadota · Halomonadaceae	<1%	6
Sphingobium yanoikuyae Pseudomonadota · Sphingobiaceae	0%	6
Stutzerimonas degradans Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	6
Tepidimonas fonticaldi Pseudomonadota	0%	6
Vibrio hibernica Pseudomonadota · Vibrionaceae	0%	6
Xanthomonas oryzae Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	6
Yersinia pseudotuberculosis Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	6
Acinetobacter sedimenti Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	5
Atlantibacter subterraneus Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	5
Brevundimonas naejangsanensis Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	5
Citrobacter tructae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	5
Franconibacter pulveris Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	5
Kosakonia oryzendophytica Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	0%	5
Melaminivora suipulveris Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	5
Mesorhizobium liriopis Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	5
Mesosutterella faecium Pseudomonadota · Sutterellaceae	<1%	5
Methyloversatilis discipulorum Pseudomonadota · Sterolibacteriaceae	<1%	5
Paracoccus jeotgali Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	5
Paracoccus marcusii Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	5
Proteus alimentorum Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	5
Proteus hauseri Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	5
Pseudomonas oryzihabitans Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	5
Pseudomonas versuta Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	5
Pseudomonas weihenstephanensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	5
Psychrobacter maritimus Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	5
Saezia sanguinis Pseudomonadota · Saeziaceae	<1%	5
Siccibacter turicensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	5
Tepidiphilus succinatimandens Pseudomonadota · Hydrogenophilaceae	<1%	5
Achromobacter xylosoxidans Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	4
Alishewanella longhuensis Pseudomonadota · Alteromonadaceae	0%	4
Brevundimonas vesicularis Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	4
Burkholderia multivorans Pseudomonadota · Burkholderiaceae	0%	4
Comamonas terrigena Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	4
Diaphorobacter nitroreducens Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	4
Metapseudomonas otitidis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	4
Methylibium petroleiphilum Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	<1%	4
Methylophilus methylotrophus Pseudomonadota · Methylophilaceae	<1%	4
Mixta mediterraneensis Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	4
Paenochrobactrum gallinarii Pseudomonadota · Brucellaceae	<1%	4
Paracoccus sulfuroxidans Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	4
Pseudoalteromonas nigrifaciens Pseudomonadota · Pseudoalteromonadaceae	0%	4
Pseudochrobactrum algeriensis Pseudomonadota · Brucellaceae	<1%	4
Pseudomonas triclosanedens Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	4
Psychrobacter cryohalolentis Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	4
Salinicola tamaricis Pseudomonadota · Halomonadaceae	0%	4
Serratia grimesii Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	4
Sphingomonas paucimobilis Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	0%	4
Thauera aminoaromatica Pseudomonadota · Zoogloeaceae	<1%	4
Thauera terpenica Pseudomonadota · Zoogloeaceae	<1%	4
Thiopseudomonas alkaliphila Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	4
Acetobacter pasteurianus Pseudomonadota · Acetobacteraceae	<1%	3
Acinetobacter venetianus Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	3
Aerobium aerolatum Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	3
Aeromonas jandaei Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	3
Aeromonas sanarellii Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	3
Anaerobiospirillum thomasii Pseudomonadota · Succinivibrionaceae	<1%	3
Aquipseudomonas alcaligenes Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	3
Bradyrhizobium manausense Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	<1%	3
Brevundimonas nasdae Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	3
Burkholderia cenocepacia Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	3
Comamonas koreensis Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	3
Cupriavidus cauae Pseudomonadota · Burkholderiaceae	0%	3
Dechloromonas agitata Pseudomonadota · Azonexaceae	<1%	3
Dickeya fangzhongdai Pseudomonadota · Pectobacteriaceae	0%	3
Ectopseudomonas composti Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	3
Erythrobacter cryptus Pseudomonadota · Erythrobacteraceae	0%	3
Kosakonia pseudosacchari Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	3
Lelliottia aquatilis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	3
Mannheimia massilioguelmaensis Pseudomonadota · Pasteurellaceae	<1%	3
Moraxella catarrhalis Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	3
Neisseria lactamica Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	3
Nitrosomonas europaea Pseudomonadota · Nitrosomonadaceae	<1%	3
Pantoea brenneri Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	3
Paracoccus alkenifer Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	3
Phenylobacterium kunshanense Pseudomonadota · Caulobacteraceae	0%	3
Proteus faecis Pseudomonadota · Morganellaceae	<1%	3
Pseudocitrobacter vendiensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	3
Pseudomonas asiatica Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	3
Pseudomonas faucium Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	3
Pseudomonas koreensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	3
Pseudomonas nitroreducens Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	3
Pseudomonas viridiflava Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	3
Pseudoxanthomonas mexicana Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	3
Psychrobacter sanguinis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	3
Shewanella baltica Pseudomonadota · Shewanellaceae	0%	3
Shimwellia blattae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	3
Siccibacter colletis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	3
Sphingobium limneticum Pseudomonadota · Sphingobiaceae	<1%	3
Sphingomonas ursincola Pseudomonadota · Blastomonadaceae	0%	3
Sphingopyxis granuli Pseudomonadota · Sphingopyxidaceae	<1%	3
Sphingosinicella microcystinivorans Pseudomonadota · Sphingosinicellaceae	<1%	3
Stenotrophomonas acidaminiphila Pseudomonadota · Lysobacteraceae	0%	3
Tibeticola sediminis Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	3
Achromobacter insuavis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	0%	2
Acinetobacter amyesii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	2
Acinetobacter gandensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	2
Acinetobacter haemolyticus Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	2
Acinetobacter sichuanensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	2
Acinetobacter tandoii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	2
Aeromonas bivalvium Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	2
Antarcticirhabdus aurantiaca Pseudomonadota · Aurantimonadaceae	0%	2
Aquamicrobium defluvii Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	2
Blastomonas aquatica Pseudomonadota · Blastomonadaceae	0%	2
Brevundimonas pondensis Pseudomonadota · Caulobacteraceae	<1%	2
Brevundimonas viscosa Pseudomonadota · Caulobacteraceae	0%	2
Brucella tritici Pseudomonadota · Brucellaceae	<1%	2
Comamonas aquatica Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	2
Devosia equisanguinis Pseudomonadota · Devosiaceae	<1%	2
Devosia faecipullorum Pseudomonadota · Devosiaceae	<1%	2
Enterobacillus tribolii Pseudomonadota · Hafniaceae	<1%	2
Franconibacter helveticus Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	2
Herbaspirillum huttiense Pseudomonadota · Oxalobacteraceae	0%	2
Kingella denitrificans Pseudomonadota · Neisseriaceae	0%	2
Kingella pumchi Pseudomonadota · Neisseriaceae	0%	2
Kluyvera genomosp. 1 Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	2
Lampropedia aestuarii Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	2
Laribacter hongkongensis Pseudomonadota · Aquaspirillaceae	<1%	2
Lautropia dentalis Pseudomonadota · Burkholderiaceae	0%	2
Luteimonas colneyensis Pseudomonadota · Lysobacteraceae	0%	2
Luteimonas mephitis Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	2
Luteimonas wenzhouensis Pseudomonadota · Lysobacteraceae	0%	2
Marinospirillum minutulum Pseudomonadota · Oceanospirillaceae	<1%	2
Methylorubrum rhodesianum Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	0%	2
Moraxella canis Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	2
Nitrosomonas stercoris Pseudomonadota · Nitrosomonadaceae	<1%	2
Oligella urethralis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	0%	2
Ottowia massiliensis Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	2
Paenacidovorax caeni Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	2
Pantoea anthophila Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	2
Pantoea deleyi Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	2
Pantoea endophytica Pseudomonadota · Erwiniaceae	0%	2
Pantoea eucrina Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	2
Paracoccus aeridis Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	2
Paracoccus solventivorans Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	2
Pelistega indica Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	2
Photobacterium iliopiscarium Pseudomonadota · Vibrionaceae	0%	2
Pseudomonas entomophila Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	2
Pseudomonas luteola Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	2
Pseudomonas monteilii Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	2
Pseudomonas mosselii Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	2
Pseudomonas qingdaonensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	2
Pseudomonas saxonica Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	2
Pseudoxanthomonas winnipegensis Pseudomonadota · Lysobacteraceae	0%	2
Psychromonas arctica Pseudomonadota · Psychromonadaceae	0%	2
Rahnella aceris Pseudomonadota · Yersiniaceae	0%	2
Reyranella massiliensis Pseudomonadota · Reyranellaceae	0%	2
Rheinheimera tangshanensis Pseudomonadota · Chromatiaceae	0%	2
Roseateles asaccharophilus Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	<1%	2
Serratia rubidaea Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	2
Solilutibacter oculi Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	2
Solilutibacter tolerans Pseudomonadota · Lysobacteraceae	0%	2
Sphaerotilus natans Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	0%	2
Sphingobium indicum Pseudomonadota · Sphingobiaceae	0%	2
Sphingomonas melonis Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	<1%	2
Undibacterium griseum Pseudomonadota · Oxalobacteraceae	<1%	2
Vibrio brasiliensis Pseudomonadota · Vibrionaceae	0%	2
Vibrio cholerae Pseudomonadota · Vibrionaceae	<1%	2
Vibrio fluvialis Pseudomonadota · Vibrionaceae	<1%	2
Vibrio furnissii Pseudomonadota · Vibrionaceae	<1%	2
Wohlfahrtiimonas populi Pseudomonadota · Ignatzschineriaceae	<1%	2
Xanthomonas citri Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	2
Acetobacter cibinongensis Pseudomonadota · Acetobacteraceae	<1%	1
Acetobacter peroxydans Pseudomonadota · Acetobacteraceae	0%	1
Acetobacter senegalensis Pseudomonadota · Acetobacteraceae	<1%	1
Achromobacter aegrifaciens Pseudomonadota · Alcaligenaceae	0%	1
Achromobacter denitrificans Pseudomonadota · Alcaligenaceae	0%	1
Acidovorax delafieldii Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	1
Acidovorax kalamii Pseudomonadota · Comamonadaceae	<1%	1
Acinetobacter beijerinckii Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	1
Acinetobacter bohemicus Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Acinetobacter bouvetii Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Acinetobacter celticus Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Acinetobacter gerneri Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	1
Acinetobacter indicus Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Acinetobacter pragensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Acinetobacter pullicarnis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	1
Acinetobacter rongchengensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	1
Acinetobacter tianfuensis Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	1
Acinetobacter variabilis Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Advenella faeciporci Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Advenella kashmirensis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Aeromonas salmonicida Pseudomonadota · Aeromonadaceae	0%	1
Afipia birgiae Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	0%	1
Alcaligenes aquatilis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	0%	1
Aliidiomarina quisquiliarum Pseudomonadota · Idiomarinaceae	<1%	1
Amaricoccus macauensis Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	1
Aquamicrobium lusatiense Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	0%	1
Azospira oryzae Pseudomonadota · Rhodocyclaceae	0%	1
Bordetella bronchiseptica Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Bordetella trematum Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Bradyrhizobium denitrificans Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	<1%	1
Bradyrhizobium diazoefficiens Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	0%	1
Bradyrhizobium japonicum Pseudomonadota · Nitrobacteraceae	0%	1
Brucella abortus Pseudomonadota · Brucellaceae	<1%	1
Buchnera aphidicola Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Burkholderia vietnamiensis Pseudomonadota · Burkholderiaceae	<1%	1
Caldimonas caldifontis Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	<1%	1
Candidatus Fonsibacter ubiquis Pseudomonadota · Candidatus Pelagibacteraceae	0%	1
Caulobacter vibrioides Pseudomonadota · Caulobacteraceae	0%	1
Cedecea davisae Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	1
Chelativorans petroleitrophicus Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	0%	1
Chelatococcus composti Pseudomonadota · Chelatococcaceae	<1%	1
Cognatilysobacter xinjiangensis Pseudomonadota · Lysobacteraceae	0%	1
Cronobacter dublinensis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	1
Cronobacter universalis Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	1
Cupriavidus metallidurans Pseudomonadota · Burkholderiaceae	0%	1
Edwardsiella hoshinae Pseudomonadota · Hafniaceae	<1%	1
Elstera cyanobacteriorum Pseudomonadota · Rhodospirillaceae	<1%	1
Enterobacter oligotrophicus Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	0%	1
Enterovirga aerilata Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	0%	1
Erwinia billingiae Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Erwinia persicina Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Ewingella americana Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	1
Falsochrobactrum shanghaiense Pseudomonadota · Brucellaceae	<1%	1
Gibbsiella quercinecans Pseudomonadota · Yersiniaceae	<1%	1
Gluconobacter japonicus Pseudomonadota · Acetobacteraceae	<1%	1
Gulbenkiania indica Pseudomonadota · Chromobacteriaceae	<1%	1
Halopseudomonas formosensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	1
Halopseudomonas xiamenensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	1
Hankyongella ginsenosidimutans Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	0%	1
Hydrogenophaga pseudoflava Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	1
Ignatzschineria rhizosphaerae Pseudomonadota · Ignatzschineriaceae	<1%	1
Kerstersia gyiorum Pseudomonadota · Alcaligenaceae	0%	1
Kingella negevensis Pseudomonadota · Neisseriaceae	<1%	1
Kinneretia aquatilis Pseudomonadota · Sphaerotilaceae	0%	1
Kosakonia quasisacchari Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	0%	1
Kosakonia radicincitans Pseudomonadota · Enterobacteriaceae	<1%	1
Larsenimonas salina Pseudomonadota · Halomonadaceae	0%	1
Leminorella richardii Pseudomonadota · Budviciaceae	0%	1
Marinobacter adhaerens Pseudomonadota · Marinobacteraceae	<1%	1
Melaminivora alkalimesophila Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	1
Mesopusillimonas faecipullorum Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Mesorhizobium denitrificans Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	1
Methylobacterium aerolatum Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	<1%	1
Methylobacterium aquaticum Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	0%	1
Methylobacterium fujisawaense Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	0%	1
Methylobacterium oryzae Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	0%	1
Methylobacterium persicinum Pseudomonadota · Methylobacteriaceae	0%	1
Mixta gaviniae Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Mixta hanseatica Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Modicisalibacter muralis Pseudomonadota · Halomonadaceae	0%	1
Moraxella lincolnii Pseudomonadota · Moraxellaceae	0%	1
Moraxella nonliquefaciens Pseudomonadota · Moraxellaceae	<1%	1
Neoaquamicrobium sediminum Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	0%	1
Noviherbaspirillum aerium Pseudomonadota · Oxalobacteraceae	0%	1
Novilysobacter avium Pseudomonadota · Lysobacteraceae	<1%	1
Novispirillum itersonii Pseudomonadota · Novispirillaceae	<1%	1
Novosphingobium barchaimii Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	<1%	1
Novosphingobium ginsenosidimutans Pseudomonadota · Sphingomonadaceae	<1%	1
Oceanisphaera profunda Pseudomonadota · Aeromonadaceae	<1%	1
Ollibium composti Pseudomonadota · Phyllobacteriaceae	<1%	1
Paenalcaligenes hominis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Paenalcaligenes suwonensis Pseudomonadota · Alcaligenaceae	<1%	1
Paenirhodobacter populi Pseudomonadota	0%	1
Pandoraea nosoerga Pseudomonadota · Burkholderiaceae	0%	1
Pannonibacter phragmitetus Pseudomonadota · Stappiaceae	0%	1
Pantoea alhagi Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Pantoea ananatis Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Pantoea coffeiphila Pseudomonadota · Erwiniaceae	<1%	1
Pantoea stewartii Pseudomonadota · Erwiniaceae	0%	1
Paracidovorax wautersii Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	1
Paracoccus acridae Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Paracoccus aerius Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	1
Paracoccus aminovorans Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Paracoccus haematequi Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	1
Paracoccus lutimaris Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Paracoccus marinus Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Paracoccus salipaludis Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Paracoccus sanguinis Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Paracoccus yeei Pseudomonadota · Paracoccaceae	0%	1
Pectobacterium aroidearum Pseudomonadota · Pectobacteriaceae	0%	1
Pelagivirga sediminicola Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	1
Pelomicrobium methylotrophicum Pseudomonadota	0%	1
Photobacterium damselae Pseudomonadota · Vibrionaceae	<1%	1
Photobacterium phosphoreum Pseudomonadota · Vibrionaceae	0%	1
Pontibaca salina Pseudomonadota · Roseobacteraceae	<1%	1
Providencia sneebia Pseudomonadota · Morganellaceae	0%	1
Pseudacidovorax intermedius Pseudomonadota · Comamonadaceae	0%	1
Pseudidiomarina indica Pseudomonadota · Idiomarinaceae	<1%	1
Pseudoduganella guangdongensis Pseudomonadota · Oxalobacteraceae	0%	1
Pseudogemmobacter faecipullorum Pseudomonadota · Paracoccaceae	<1%	1
Pseudolabrys taiwanensis Pseudomonadota · Xanthobacteraceae	0%	1
Pseudomonas arcuscaelestis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	1
Pseudomonas atacamensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	1
Pseudomonas edaphica Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas endophytica Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas fluvialis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas guariconensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas jilinensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas lurida Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas marginalis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	0%	1
Pseudomonas parasichuanensis Pseudomonadota · Pseudomonadaceae	<1%	1

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